শিশুরা অনেক সময় বিভিন্ন কারণে খাবার খেতে চায় না। এটি সাধারণ অভ্যাসজনিত সমস্যা থেকে শুরু করে শারীরিক অসুস্থতার কারণেও হতে পারে। 
নিচে শিশুর খাবার না খাওয়ার প্রধান কারণগুলো দেওয়া হলো:
১. অভ্যাস ও পরিবেশগত কারণ 
জোর করে খাওয়ানো: শিশুকে জোর করে খাওয়ালে খাবারের প্রতি তার ভীতি বা অনীহা তৈরি হয়।
অতিরিক্ত নাস্তা বা বাইরের খাবার: খাবারের মাঝামাঝি সময়ে চিপস, চকলেট, বিস্কুট বা মিষ্টি পানীয় খেলে মূল খাবারের সময় ক্ষুধা থাকে না।
মনোযোগ বিচ্যুতি: খাওয়ার সময় মোবাইল দেখা বা টিভি চালিয়ে রাখলে শিশু খাবারের স্বাদ বুঝতে পারে না এবং খাওয়ার আগ্রহ হারিয়ে ফেলে।
একই ধরনের খাবার: প্রতিদিন একই স্বাদ বা টেক্সচারের খাবার দিলে শিশু একঘেয়েমি বোধ করে। 
২. শারীরিক ও স্বাস্থ্যগত কারণ
অসুস্থতা: সর্দি, কাশি, জ্বর, পেটে কৃমি বা কোষ্ঠকাঠিন্যের কারণে রুচি কমে যায়।
দাঁত ওঠা: শিশুদের মাড়িতে ব্যথা বা অস্বস্তি হলে তারা শক্ত খাবার এড়িয়ে চলতে চায়।
পুষ্টির অভাব: শরীরে আয়রন (রক্তস্বল্পতা) বা জিঙ্কের অভাব হলে ক্ষুধা কমে যাওয়ার সম্ভাবনা থাকে।
অরুচি: অন্ত্রে উপকারি ব্যাকটেরিয়ার অভাব বা ভিটামিন ডি ও সি-এর ঘাটতিও অরুচির কারণ হতে পারে। 
৩. বৃদ্ধি ও বিকাশজনিত কারণ
বৃদ্ধির হার কমে যাওয়া: এক বছর বয়সের পর শিশুর বৃদ্ধির গতি কিছুটা ধীর হয়ে আসে, ফলে তাদের ক্যালরির চাহিদাও কমে যায় (যাকে ফিজিওলজিক্যাল অ্যানোরেক্সিয়া বলা হয়)।
খাবার নির্বাচনে অনীহা (Food Neophobia): ছোট শিশুরা অনেক সময় নতুন স্বাদের বা নতুন ধরনের খাবার দেখে ভয় পায় এবং তা খেতে অস্বীকার করে।